Iekšējā pudendālā artērija sazarojas ar iekšējo iliac artēriju un piegādā ar skābekli bagātinātas asinis gan vīriešu, gan sieviešu ārējiem dzimumorgāniem. Tomēr dzimuma dēļ pastāv dažas anatomiskas atšķirības.
Sievietēm artērija mēdz būt mazāka. Arī daži no artērijas zariem ir raksturīgi dzimumam. Vīriešiem šīs artērijas zari ietver dzimumlocekļa muguras un dziļo artēriju, savukārt sievietēm ir klitora muguras un dziļa artērija. Sievietēm ir aizmugurējie labiālie zari, turpretī vīriešiem ir sēklinieku zari. No šīs artērijas ir arī citi trauki, kas raksturīgi dzimumorgāniem.
Apakšējās taisnās zarnas un starpsienas artērijas, kas sazarojas no iekšējās pudendālās artērijas, abiem dzimumiem ir vienādas.